Veldig lang halveringstid er nødvendigvis ikke optimalt når det gjelder vaksiner mot smittsomme sykdommer (eks virus), dette fordi ethvert “fremmedstoff” (eks et virusprotein/-peptid) vil gi en lengre immunrespons. Denne immunresponsen kan gjerne ansees som en lokal betennelse/inflammasjon. Og man ønsker definitivt ikke å ha en langvarig immunrespons siden det øker sannsynligheten for auto-immune reaksjoner.
På den annen side er ikke halveringstiden til circRNA fra Circio sine studier - 135 timer- så veldig lenge. Fordelen er at man får produsert mer protein fra mye mindre RNA med cRNA sammenlignet med mRNA.
I Moderna sin Covid mRNA vaksine så må det brukes VELDIG mye mRNA for å være sikre på at nok celler tar det opp og lager vaksinekomponenten. Majoriteten av dette mRNA vil brytes raskt ned (enten i blodet pga RNA-ødeleggende enzymer, RNaser) eller fordi det blir transportert til leveren. Høye doser i blodet øker også sannsynligheten for at mRNA`et også transporteres til andre organer der det ikke er ønskelig at de skal være.
Det er altså langt å foretrekke å ha lavest mulig konsentrasjon av et RNA-molekyl som gir høy produksjon av protein over en periode slik at man er sikret en god immunrespons.
Alt tilsier at circRNA er overlegent mRNA på alle disse punktene.
circRNA er mye mindre utsatt for RNaser fordi det er sirkulært og lukket. mRNA er lineært og åpent, og derfor utsatt for nedbryting. mRNA skal ha kort levetid i utgangspunktet og det er mange mekanismer for å fjerne disse når de har gjort jobben sin.
mRNA som koder for fremmede gener (eks virus) har også en signatur som blir gjenkjent som et faresignal. Cellene er utstyrt med forsvarsmekanismer for å fjerne slikt fremmed mRNA.
Også her vil circRNA ha en fordel siden dette har en struktur med regulatoriske funksjoner, altså det skal i utgangspunktet ikke brukes til proteinsyntese (men designer man dem rett gjør de dette veldig godt). circRNA er derfor mindre utsatt for nedbryting, noe som alene gjør at de vil kunne lage proteiner lengre enn mRNA.
For genetiske sykdommer er det kun en fordel at halveringstiden er lang, dette fordi man da designer et protein som ikke er fremmed for vertscellen og som skal erstatte et defekt protein som gir sykdom.
Og for kreft er lang virketid viktig siden man ønsker å booste immunforsvaret til å drepe kreftcellene. Kreftceller er eksperter på å fjerne signaler om lokale betennelser, siden dette tiltrekker seg immunceller.